- Đại chủng viện Thánh Giuse Hà Nội (ở Hà Nội)
- Đại chủng viện Huế (ở Thừa Thiên - Huế)
- Đại chủng viện Thánh Giuse TP. Hồ Chí Minh (ở TP. Hồ Chí Minh)
- Đại chủng viện Sao Biển Nha Trang (ở Khánh Hòa)
- Đại chủng viện Vinh Thanh (ở Nghệ An)
- Đại chủng viện Thánh Quý (ở Cần Thơ)
Ngày 14/12/2005, Chính phủ chấp thuận cho thành lập Đại chủng viện Thánh Giuse cơ sở II tại Xuân Lộc để đào tạo Linh mục cho bốn giáo phận: Bà Rịa, Đà Lạt, Phan Thiết và Xuân Lộc.
Ngày 26/8/2006: Đức Cha Đaminh Nguyễn Chu Trinh đặt viên đá đầu tiên khởi công xây dựng Đại chủng viện cùng với tòa Giám mục và trung tâm mục vụ của Giáo Phận.
Ngày 26/9/2008: Thánh lễ Cảm tạ Hồng ân công trình xây dựng Tòa Giám Mục và Đại chủng viện cơ bản đã hoàn thành và được đưa vào sử dụng.